臺南沙崙是中央政府5＋2產業綠能科技發展重鎮；與臺南市府共同見證沙崙轉型與產業興起，陽明交大是沙崙綠能科學城第一個進駐的單位，早於民國98年在「奇美樓」落成後即成立臺南分部並設立「光電學院」培育英才。沙崙綠能科學城的硬體建設始於107年初，配合園區發展需要，本校於108學年度成立「智慧科學暨綠能學院」，帶動強化臺南產學研聚落綜效。113年緯創資通與群聯電子將於臺南校區內啟動2棟產學大樓興建，為產學共創建立雙向互惠機制；企業不僅投入經費，同時讓業界師資回到校園，與學校共同投入研究能量，進行知識擴散與技術移轉，並建立長期合作關係，培養學用合一的人才，成為產學共創的典範。因應少子化所導致的人才缺乏，臺南分部以本校豐富的教學和研究資源為基礎，積極推動延伸與推廣教育，將高深的學理知識應用於產業當中，培育符合產業需求之優質科技人才，並透過科研成果的轉化和應用，為當地科技產業的發展提供更多的支持和動力，與地方及產業界共創共榮。